舰队分配是无尽的拉格朗日中决定战斗效率的核心策略。根据舰船功能可分为八类：前排能打能扛型（如奇美拉、066）、前排肉盾型（如ST59）、前排输出型（如斗牛级）、中排高攻型（如大帝、永恒风暴）、后排高攻型（如卡利斯托）、高攻低防型护卫舰、支援型维修船以及高人口战巡航母。移动速度是常被忽视的关键属性，舰队整体速度由最慢舰船决定，需将龟速型（250移速）、慢速型（400-500移速）、普通型（650移速）和高速型（800+移速）合理搭配。
主力舰队与输出舰队需采用差异化配置。主力舰队应以6艘以上能打能扛型或肉盾型舰船为前排，搭配高攻高血量的巡洋舰作为中后排核心，必要时通过增援指令补充ST59或大帝级战巡增强攻防能力。输出舰队则侧重高移速属性，优先选择永恒风暴等高速舰船，避免因增援拖慢速度而影响包夹效率。两支舰队需协同作战，主力负责正面推进，输出舰队执行侧翼突袭。
防空类母舰建议编入输出舰队针对敌方航母，拆家任务需单独组建高速攻城舰队，由诺玛等舰船快速破坏敌方设施。维修船在游戏后期效果有限，仅建议在对抗NPC或低级城防时编入主力舰队。载机舰的部署需评估战场制空权需求，载机维修模块会牺牲部分输出换取生存能力。
资源采集与战斗舰队的比例直接影响发展节奏。工程船应优先建造并强化采集技能，中型工程船需逐步替代低级单位。战斗舰队初期以护卫舰为主，基地三级后谨慎补充驱逐舰，四级时重点发展载机型支援工程舰。采矿平台需配置护卫舰保护，资源点储量有限需定期更换。联盟协作能有效弥补个体舰队配置不足，通过资源共享和联合防守提升整体生存率。
舰队命名具有战术迷惑价值，可通过反向标注误导敌方判断。300指挥值上限需通过基地升级扩展至400，舰船位置由系统自动按蓝图定位分配。技术点分配具有不可逆性，需针对特定舰船型号精准强化。未央理财计划的高性价比投资能显著加速舰队成型速度，但需注意技术储备的平衡发展。
